Кстати! Судя по фотографиям удар был сзади. Крышка испытала воздействие вперёд и вверх. Соответственно петли-рычаги, на которых крышка держится, могли согнуться. Если вы вешаете крышку на свои старые петли, то ничего удивительного нет. Возможно они и "приподнимают" крышку после её установки. Попробуйте снять петли-рычаги, положите их на листы бумаги и обрисуйте по контуру. Потом приложите эти листы к петлям другого Круза. Даже малейший изгиб петли-рычага может на "плече" дать приличный зазор на установленноя крышке. Из багажника , при этом, думаю, сможете заметить, как петлт-рычаги "играют" при нажатии на крышку. Возможно , при нажатии, будет видна неболшая упругая деформация металла в местах крепления петель- рычагов к кузову или к самой крышке.
Как-то так...